番禺区中医院在国家三级公立中医综合医院绩效考核排名66位,居中医类广州市区属医院第一名; “广东省中医药宣传工作先进单位”;
骨伤科被评为国家重点专科协作单位、广东省中医重点专科、广州市“1357”工程重点中医专科(专病)、国家中医药管理局第二批农村医疗机构中医特色专科、广东医院最强科室、中医药强省建设专项中医临床重点专科、2018年度、2019年度、2020年度“中国中医医院——优秀区县临床专科”;脑病科、心血管科是广东省中医重点专科;针灸科是广州市名科;脾胃病科是广州市中医重点专科;护理部被评为中华中医药学会“第二届全国中医护理先进集体”。多年来,医院在各级组织的文体比赛中获奖累累。